- 月額在庫保管手数料は、日々の保管スペース使用量と対象月の料金区分で計算される
- SKUの梱包後容積、サイズ区分、在庫数量の推移、対象月をそろえて再計算する
- 通常の保管料と在庫保管追加手数料・長期在庫関連費用などを混ぜない
Seller Centralで実際に請求されたFBA在庫保管手数料が、仕入れ前の利益計算と一致しない――その原因は、計算ミスだけとは限りません。月額の料金を「販売した商品1個当たりの固定費」として扱ったり、月末の在庫数だけで計算したりすると、請求額との間に差が生じます。
この記事では、請求・見積もりの計算条件をそろえて照合する作業に絞ります。FBA全体の利益計算についてはAmazon FBA利益計算ツールガイドも参照してください。

1.最初にそろえる5つの計算条件
照合前に「料金表を見た月」「商品を数えた日」「実際に引かれた請求日」が混在していないか確認しましょう。次の5点を先に固定します。
| 必要な項目 | 確認のポイント |
|---|---|
| 対象マーケットプレイスと料金適用月 | Amazon.co.jpか、10月分など何月の保管費か |
| 梱包後の商品の寸法・容積 | Amazonが手数料計算に使用する商品サイズと、自社入力寸法が一致するか |
| サイズ区分・商品カテゴリー | 小型/標準、大型/特大型、服・シューズ等の区分 |
| 月内の日別在庫数量 | 月初・月末だけではなく、増減した日と数量 |
| 請求明細の項目名・適用除外 | 通常の月額保管料か、その他の追加料金か、割引・免除があるか |
2.保管料・配送代行料・追加手数料の区分
| 項目 | おおまかな発生単位 | 通常の保管料との違い |
|---|---|---|
| 在庫保管手数料 | 在庫の保管スペースと保管期間 | 商品が売れていなくても発生し得る |
| FBA配送代行手数料 | 出荷された注文・商品に関係する費用 | 在庫を倉庫に置いた日数で課金するものではない |
| 在庫保管追加手数料 | 適用条件を満たす出品者・在庫の保管状況 | 月額保管料とは別の料金項目 |
| 長期保管関連の追加手数料 | 在庫保管期間など個別の適用要件 | 通常の月額保管料に合算される場合は分けて確認 |
| 納品・返送・廃棄などの費用 | 納品・返送・処理等のイベント | 月額保管料の算式とは異なる |
たとえば「FBA費用の合計」として5,000円が計上されていても、内訳のうち通常の在庫保管手数料が2,000円で、残りが別の費用なら、5,000円を通常保管料の式で再現しようとしても一致しません。まず費用項目ごとに分解してください。

在庫保管手数料自体の基本説明や在庫回転率への影響は、FBA在庫保管手数料の仕組みとFBA在庫管理の基本で扱っています。
3.公式料金表の季節・サイズ・カテゴリーを確認
Amazonの日本向け公式料金ページでは、月額在庫保管手数料はフルフィルメントセンターでの1日当たりの平均スペース使用量に基づいて算出すると案内されています。下記は公式料金表で確認できる通常保管料の単価です(10cm×10cm×10cm=1,000cm³当たり、対象月に全期間保管した場合の基準額)。
| 商品カテゴリー・サイズ区分 | 1~9月 | 10~12月 |
|---|---|---|
| 服・ファッション小物/シューズ・バッグ以外:小型・標準 | 5.676円 | 10.087円 |
| 同:大型・特大型 | 3.278円 | 6.984円 |
| 服・ファッション小物/シューズ・バッグ:対象サイズ | 3.10円 | 5.50円 |
上表は確認時点のAmazon日本向け公開料金の抜粋です。実際の適用料金・対象区分・税の扱い・例外や免除は最新公式ページと個別の請求資料で確認してください。Amazonの料金改定案内では上記単価に10%の消費税が含まれる旨も示されています。税額を重複加算しないようご注意ください。
商品容積(cm³)÷1,000 × 該当単価(円)× 保管日数÷対象月の日数 × 対象数量。
月内に在庫数量が変わる場合は、数量が一定だった期間ごとに計算して合算します。Amazon側の測定・集計・丸め・適用条件により、明細と円単位で一致しない場合があります。
4.計算例:10月の在庫数変動を日割り計算
例として、衣料品などに該当しない小型・標準サイズの商品について、梱包後寸法が20cm×10cm×5cm=1,000cm³、10月の月額単価が10.087円、10月1日~10日は100個、10月11日~31日は60個だったと仮定します。以下は「各期間に示した数量が毎日保管されていた」教育用の架空例です。
| 期間 | 保管数量 | 日数 | 延べ在庫数(個・日) |
|---|---|---|---|
| 10月1~10日 | 100個 | 10日 | 1,000個・日 |
| 10月11~31日 | 60個 | 21日 | 1,260個・日 |
| 合計 | — | 31日 | 2,260個・日 |
計算:10.087円 × (1,000cm³÷1,000cm³) × 2,260個・日 ÷31日=約735.37円。この例では1個当たりの体積が基準の1,000cm³と一致するため、体積係数が1です。
月末の在庫60個だけを使って「10.087円×60個=605.22円」と計算した場合、月初の100個を保管していた期間が無視されます。逆に月初100個で1か月分を計算した「1,008.70円」も過大になります。数量が変わる月は、月末残数ではなく期間ごとの在庫推移を使って照合します。
5.請求額と計算が合わないときの照合手順
- 対象月を固定:請求書・入金/取引明細で「何月分」の保管料か確認します。引き落とされた日と在庫を保管していた月を混同しないでください。
- 料金項目を分類:通常の在庫保管手数料と、保管追加手数料、長期在庫関連費用、配送代行費用などを別列に分けます。
- 商品別のサイズ・容積を照合:商品実寸ではなく、Amazonの課金計算に使われた寸法・区分を確認します。寸法が想定と違うなら再測定・確認の対象です。
- 月内の保管数量を復元:FBA関連レポート・在庫の動きから入庫・出庫日を整理し、月内の日別数量の変化を確認します。
- その月の料率で再計算:1~9月と10~12月、サイズ・カテゴリ区分、例外・免除の有無を確認します。
- 差額を注記:請求明細の数量・容積・丸めなどの違いを原因別に分類し、必要に応じてSeller Centralから問い合わせます。
どのレポートを見る?
Seller Centralでは、利用可能なFBAの保管料関連レポート、在庫レポート、支払い・取引関連の明細を確認します。画面のメニューやレポート名は変更されるため、「在庫保管手数料」「月次保管料」「支払い」「在庫の動き」などの項目を手掛かりに、対象ASIN/SKUと月を一致させてください。権限によって表示が異なる場合もあります。
6.SellerSprite利益計算機で試算条件をそろえる
セラースプライトの利益計算機では、マーケットプレイスを日本に切り替えて、梱包サイズ・重量、商品原価、FBA納品送料、販売価格、広告費、保管期間(月)などを入力できます。計算結果には「1月~9月」「10月~12月」の保管費用・総保管料などの表示があるため、料金時期の違いを意識した事前の採算試算に利用できます。

| 比較するデータ | SellerSpriteで行うこと | 最終的な確認先 |
|---|---|---|
| 梱包サイズ | 実際の梱包後寸法を入力 | Amazonの課金対象寸法・区分 |
| 保管期間 | 1か月・3か月など複数条件で試算 | 実際の保管日数と在庫変動 |
| 月別料金 | 1~9月/10~12月の計算結果を確認 | 対象月のAmazon最新料金 |
| 利益への影響 | 純利益・利益率・ROIの変化を見る | Seller Centralの請求・販売実績 |
重要:利益計算機は請求書の再発行機能ではありません。入力した「保管期間」と実際の日別在庫変化は必ずしも一致しないため、請求額の照合にはAmazonの実績資料を優先してください。シミュレーターで条件を変えながら、保管期間が長引いた場合の利益リスクを見積もるという使い方が適しています。
7.差額の原因別チェックリスト
| 差額の兆候 | よくある原因候補 | 再確認する情報 |
|---|---|---|
| 請求額が想定より大きい | サイズ・容積の入力差、繁忙期料金 | Amazonの寸法、料金適用月 |
| 月末在庫から計算すると合わない | 月内に在庫数が変化 | 入庫・出庫による日別数量 |
| 通常保管料だけでは再現できない | 別の保管関連追加手数料が含まれる | 項目別の請求内訳 |
| 利益計算機の表示と一致しない | 保管期間・市場・通貨・為替の条件差 | 日本マーケット、入力寸法とコスト |
| 請求額が予想より小さい | 対象商品の免除・特典・調整 | 対象プログラム・返金・調整明細 |
新規出品者や対象商品では、AmazonのFBA新商品特典などによる手数料免除が適用されるケースがあります。ただし、すべてのSKUが自動的に免除されるわけではありません。適用資格や対象期間を必ず確認しましょう。
8.毎月の照合シートを残す方法
| 月次照合シートの列 | 入力内容 |
|---|---|
| 対象月・SKU・ASIN | 例:2026-10/SKU-01/対象ASIN |
| 商品カテゴリー・サイズ区分 | 例:一般商品/小型・標準 |
| 課金対象容積 | 例:1,000cm³/個 |
| 日別在庫数と日数 | 例:100個×10日+60個×21日 |
| 適用単価と計算結果 | 例:10.087円/約735.37円 |
| 実際の通常保管料 | Amazonの対象明細から転記 |
| その他追加料金・免除 | 通常保管料とは別行で管理 |
| 差額・根拠・次回確認 | 寸法差/月の取り違え等を記録 |
毎月同じ列で保存すると、請求差額の原因や季節料金の変化を追跡しやすくなります。
9.よくある質問(FAQ)
Q.FBA在庫保管手数料は売れた個数で計算されますか?
通常の在庫保管手数料は、売れた数そのものではなく、Amazon倉庫で使用する保管スペースと保管期間に基づきます。
Q.月末のFBA在庫数で1か月分を計算してもよいですか?
月内で数量が変わる場合は不正確です。日別または数量が一定だった各期間の保管数量を使って計算します。
Q.1~9月と10~12月で同じ料率ですか?
いいえ。日本向けの通常在庫保管手数料には季節による単価の区分があります。最新のAmazon公式料金表を確認してください。

